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新干线超进化研究所为了从诞生于“漆黑新干线”的巨大怪物体手中守护日本的未来， 人们开发了“新干线变形机器人SHINKALION”。 具备与SHINKALION较高适合率的孩子们成为驾驶员， 与研究所员齐心协力，面对强大的敌人！ 究竟“漆黑新干线”的目的是……。孩子们能否守护日本的未来……。 变身！SHINKALION！。一名从阿富汗战争中归来的士兵揭露了一个阴谋。这个阴谋涉及到情报服务和一帮毒贩。作为一位老兵，他的任务是否可以顺利完成呢？。